Предсказание наиболее вероятных органических молекул из первых принципов
Российские исследователи объяснили, почему анализ нефти, межзвёздной среды и некоторых более приземлённых материй обнаруживает ряд типичных соединений углерода, азота и водорода, в то время как молекулы с другими сочетаниями тех же трёх атомов не встречаются. Эта работа превращает набор стихийно скопившихся в органической химии наблюдений и обобщений касательно поведения веществ в стройную систему, в основе которой — принципы квантовой физики
Кроме того, опубликованное в The Journal of Physical Chemistry Letters исследование подскажет астрохимикам, какие новые органические молекулы наиболее вероятны в космосе.
«В каком-то смысле органическую химию до сих пор преподают как телефонный справочник, — рассуждает руководитель исследования профессор Сколтеха Артём Оганов. — Некоторые молекулы устойчивы и потому встречаются часто. Другие — нет. Одни вступают в реакции охотно, другие — наоборот. Но почему? Мы знаем закономерности для основных веществ и их классов, но нет целостной системы, которая бы строилась от самых базовых принципов к частным случаям. А есть своего рода дневник разрозненных наблюдений, пусть и очень подробный».
«Наша работа исправляет эту ситуацию применительно к системе „углерод — азот — водород": мы предсказываем и объясняем с позиции фундаментальных принципов квантовой теории, какие соединения этих трёх элементов наиболее стабильны, наиболее инертны, и почему так, — продолжает химик. — Теперь на одной картинке умещается вся химия этой системы, которую к настоящему моменту наблюдали в космосе или, скажем, в нефтях, и даже остаётся задел на будущее». В основе подхода лежит позаимствованное из ядерной физики понятие «магических» атомных ядер: магическими называют такие молекулы, энергия которых ниже, чем у всех близкородственных молекул.
Карта устойчивости молекул с формулой CmN1Hk, где количество атомов углерода и водорода варьируется от 0 до 12 по осям m и k, соответственно, а атом азота один. Высота столбика по вертикали означает меру стабильности соединения. В числе стабильных («магических») молекул — аммиак (NH3), множество хорошо известных веществ, а также ближайший родственник скатола C9NH9 — знакомого всем крайне зловонного вещества. Пиктограммы трёх видов над столбиками обозначают те соединения, которые известны из анализа межзвёздной среды, атмосферы спутника Сатурна Титана и нефти. Источник: Елизавета Ванеева и др./The Journal of Physical Chemistry Letters
По законам физики материя всегда стремится принять состояние самой низкой энергии. Как следствие, утончённые, высокоорганизованные формы естественным образом деградируют без постоянных вливаний энергии извне (плохие новости для родителей). Еда — хороший пример: в спелом яблоке сконцентрировано много энергии, и оно стремится отдать её окружающей среде (гниение) или тому счастливчику, который успеет оценить её по достоинству. Забравший энергию у яблока превратит молекулы яблока в продукты реакции, наиболее заметный из которых — по запаху, так уж точно — называется скатолом, от древнегреческого слова со значением «экскременты». Чтобы образовался скатол, энергия предшествовавших ему веществ должна так низко упасть, что молекула самого скатола очень стабильна и почти достигает статуса «магической», а собственно магической, как выяснилось, является другая молекула с идентичной формулой C9NH9 и слегка иным расположением атомов в пространстве. Конечно, про стабильность скатола химики знали и без квантовых расчётов и даже используют его — в сверхмалых концентрациях! — при изготовлении духов и мороженого, но теперь устойчивость всех комбинаций атомов CNH понятна в рамках единой системы, с точки зрения энергии этих соединений.
Первый автор научной статьи, магистрант Сколтеха Елизавета Ванеева из Лаборатории дизайна материалов, которой руководит Оганов, поделилась мыслями о потенциальной сфере применения новой карты стабильности соединений в науке и промышленности: «Наши предсказания хорошо согласуются с перечнем тех молекул, которые наблюдаются в нефти и в космосе. Нефть на сегодня уже очень тщательно изучена, но если говорить о межзвёздной среде и атмосферах других планет, то там периодически находят новую органику, и тут мы можем помочь астрохимикам, указав вероятных кандидатов для поиска. Искать такие вещи целенаправленно проще и быстрее».
«Что касается технологических применений, то представьте, что перед химиком-органиком стоит задача синтезировать какое-то промышленно значимое соединение, которое относится к рассмотренному нами классу, допустим органический краситель синего цвета, — добавила Ванеева. — Вместо того, чтобы долго проводить множество экспериментов, пытаясь понять, какие соединения окажутся стабильными, можно использовать наш метод. Он на основе фундаментальных квантово-химических расчётов предскажет вероятных кандидатов. У этого метода нет аналогов, он быстро работает, и теперь его надёжность проверена на опубликованных нефте- и астрохимических данных».
В будущем авторы исследования планируют распространить тот же подход и на другие органические системы, например белки, а также аминокислоты — составные элементы ДНК и РНК.
В освещённом в пресс-релизе исследовании также принял участие научный сотрудник Сколтеха Сергей Лепешкин. Вычисления выполнены на суперкомпьютерах «Олег» и «Аркуда» в Сколтехе, в Межведомственном суперкомпьютерном центре Российской академии наук и на суперкомпьютере «Лобачевский» в Нижегородском государственном университете. Работа поддержана грантом № 19-72-30043 Российского научного фонда.
*****
Сколтех — негосударственный международный университет (входит в группу ВЭБ.РФ), который готовит новое поколение лидеров в области науки, технологий и бизнеса, проводит передовые исследования по приоритетным направлениям научно-технологической повестки, содействует внедрению технологий и развитию предпринимательства. В институте работают центры по направлениям искусственного интеллекта, наук о жизни и агротехнологий, современной инженерии и перспективных материалов, энергоэффективности и энергоперехода, телекоммуникаций и фотоники, перспективных исследований. Основанный в 2011 году в сотрудничестве с Массачусетским технологическим институтом, Сколтех дважды вошёл в топ-100 лучших молодых университетов мира престижного рейтинга Nature Index (2019 и 2021 год), а в 2022 году стал лучшим в России университетом в области компьютерных наук, генетики и молекулярной биологии по версии рейтинга Research.com. Сайт: https://www.skoltech.ru/.
Все выпуски журнала «ЭкоГрад» в электронной версии читайте на pressa.ru,
Бумажные экземпляры спецвыпусков и книги В. Климова можно приобрести на OZON
- Подробности
- Категория: Наука
- Опубликовано 26.09.2023 14:29
- Просмотров: 1421